ปัญหาที่มักจะพบกันอยู่บ่อยๆ คือ "ใบกำกับภาษี" ที่ผู้ขายหรือผู้ให้บริการต้องออกให้กับลูกค้า โดยเฉพาะอย่างยิ่งใบกำกับภาษีเต็มรูปแบบที่ใช้เป็นหลักฐานในการขอภาษีซื้อคืน ของผู้จ่ายเงินที่ซื้อสินค้า บริการนั้นๆ ซึ่งผู้ขายจะต้องทำใบกำกับภาษีเต็มรูปตามแบบประมวลรัษฎากร โดยส่งมอบต้นฉบับใบกำกับภาษีให้แก่ผู้ซื้อ และเก็บรักษาสำเนาใบกำกับภาษี เพื่อการลงรายงานภาษีขาย ภายใน 3 วันทำการนับจากวันที่ในการเสียภาษีมูลค่าเพิ่มเกิดขึ้น ใบกำกับภาษีเต็มรูป ตามประมวลรัษฎากร อย่างน้อยต้อมมีรายการดังต่อไปนี้

จากประสบการณ์ของผู้เขียน โดยทั่วไปถ้าหากผู้ประกอบการดำเนินการถูกต้อง โอภาสจะถูกตรวจสอบหรือถูกประเมินภาษีอากรก็เกิดขึ้นได้ยาก แต่ในความเป็นจริง สถานะการเงินการคลังของประเทศก็เป็นส่วนหนึ่งที่ทำให้กรมสรรพากรมุ่งจะตรวจสอบผู้ประกอบการที่ประกอบถูกต้อง เพราะอาจพบ ดังนั้น ผู้ประกอบการจึงต้องเตรียมพร้อม เพราะแม้หากจะมีการตรวจสอบหรือประเมินภาษีอากรแล้ว ผู้ประกอบการก็สามารถเจรจากับเจ้าพนักงานได้ และหากถูกประเมินก็สามารถอุทธรณ์การประเมินดังกล่าวต่อคณะกรรมการอุทธรณ์ หรือต่อศาล เพื่อให้คำอุทธรณ์ของตนได้รับชัยชนะถึงที่สุด

การออกใบแทน สำหรับผู้ประกอบการจดทะเบียน สำหรับใบกำกับภาษี ใบเพิ่มหนี้ ใบลดหนี้ ที่ได้ออกไปแล้ว หลังจากนั้นได้รับการร้องขอจากลูกค้าผู้ซื้อสินค้า หรือบริการ ซึ่งใบที่ออกไปก่อนหน้านี้สูญหาย ถูกทำลาย หรือชำรุด ให้ผู้ประกอบการออกใบที่ได้รับการร้องขอจากผู้ซื้อสินค้า หรือบริการ (มาตรา 86/12) โดยรายการเช่นเดียวกับใบกำกับภาษี หรือใบอื่น ๆ ที่ผู้ซื้อร้องขอ โดยให้มีข้อความระบุไว้ในที่ที่เห็นเด่นชัดว่า เป็นใบแทน และออกเพื่อการใดสำหรับเอกสารใดที่ผู้ซื้อร้องขอประกาศเกี่ยวภาษีมูลค่าเพิ่ม (ฉบับที่ 36) กำหนดหลัึกเกณฑ์ และวิธีออกใบแทนได้ดังต่อไปนี้

วันนี้ ( วันที่ 22 เมษายน 2551) นายประดิษฐ์ ภัทรประสิทธิ์ รัฐมนตรีช่วยว่าการกระทรวงคลัง เป็นประธานเปิดประชุมสัมมนาพร้อมให้นโยบายผู้บริหารหน่วยงานจัดเก็บภาษี ประกอบด้วยผู้บริหารระดับสูง สรรพากรภาคและสรรพากรพื้นที่ทั่วประเทศ โดยมี นายศานิต ร่างน้อย อธิบดีกรมสรรพากร พร้อมคณะผู้บริหารระดับสูง ให้การต้อนรับ ณ โรงแรมอิมพีเรียล ควีนส์ ปาร์ค กรุงเทพ ฯ ซึ่งการประชุมดังกล่าวจัดขึ้นระหว่าง วันที่ 22-24 เมษายน 2551 โดยมีวัตถุประสงค์เพื่อกำหนดทิศทางการปฏิบัติงานตามแผนกลยุทธ์ด้านการจัดเก็บภาษีสำหรับปีงบประมาณ พ.ศ. 2551